三维分子类软件-生物科研软件汇总2022
三维分子类软件-生物科研软件汇总2022
3DNA 2.1 20141222 分析、构建、显示核酸三维结构的软件，软件需要Cygwin环境；
ACD/3D Viewer for ISIS:免费的ISISDraw三维显示插件；
ActiveICM 1.2-2 可在Office软件和浏览器中显示查看三维ICM分子图片文件软件；
Amira:高等三维显示建模系统；
AmiraMol: Amira 2.3相应的显示三维分子的增强工具；
ANTHEPROT 3D 1.0.162 蛋白三维结构查看软件 ；
ArgusLab 4.0.1 分子构型、绘图和药物设计软件；
Ascalaph 1.8.88 三维分子显示软件 和分子设计建模软件；
AutoDock 4.2.6 小分子三维建模软件 ；
Avogadro 2.0.7.2 免费三维分子编辑器 ；
BALLView 1.4.2 分子三维建模、显示软件；
Benchware 3D Explorer 2.7 三维分子显示分析软件；
Bioclipse 2.6.1 生物信息学分子显示平台；
Biodesigner 0.75 免费的分子建模与显示软件，支持多种三维分子格式；
Biodesigner:免费的分子建模与显示软件；
bioeditor 1.6.1，BioViewer 1.5.7 三维分子结构编辑软件和三维分子结构显示软件；
Chemis3D 2.89b 三维分子网页显示Java小程序；
Chemitorium 4.0 三维分子分析与现实工具软件；
CHIME 2.6 SP8 IE与NetScape浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看PDB格式的文件；
CHIME:直接在浏览器中观看3D分子；
Chimera 1.10.1 免费的交互式分子模型显示程序；
CMView 1.1.1 大分子关联图(contact map)分析工具；
CN3D 4.3.1 See in 3D的缩写。允许你在线作为客户端可视并交互地观察NCBI Entrez数据库的立体蛋白序列；
CN3D: 3D分子结构观察软件；
COSMOS 5.0 PRO trial 三维分子分析、建模、显示软件；
COSMOS Viewer 3.0 免费的三维显示软件；
Crystlnfo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构；
CueMol 2.2.1.330 免费的分子结构显示和三维渲染软件；
DINAMO:蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具；
DS Visualizer 4.1 3维分子浏览工具，30天试用版， 功能也十分强大；
DTMM 4.2 Demo 是一个简单易用的3维分子模型显示、编辑与构建程序；
DTMM:三维分子模型显示、编辑与构建程序；
Facio 18.8.2 三维分子建模、显示与量子化学计算程序；
GDIS 0.99 三维分子显示软件；
gopenmol:显示并分析分子结构及其特性；
ICM-Browser 3.8-3 3维分子浏览工具，并具有序列比对显示功能，免费推出；
ICMLite:三维分子浏览工具，有一些其他软件没有的功能；
jimp 2 0.091 显示三维分子软件；
Jmol 14.2.12 java语言写成的开放源代码的免费三维分子显示程序；
JMVC:使用JAVA技术编写的三维分子查看器；
JMVS 4 041122版 Java3D Molecular Visualisation System 的缩写，使用JAVA技术编写的三维分子查看器；
KiNG 2.21 (Kinemage, Next Generation)的缩写。三维分子Kinemage的显示软件；
LigandScout 3.12 用三维模型高分子 / 配合物构建药效团模型结构数据工具软件；
Mage 6.47 读取并演示Kinemage格式文件的专用软件；
Mage:读取并演示Kinemage格式文件的专用软件；
MarvinView: JAVA语言编写的化学分子二维与三维显示程序；
MegaPov 1.2.1 是Pov-Ray非官方编译版本，三维渲染效果更好。需要安装Pov-Ray；
MMPRO 0.7 分子显示分析软件；
MOIL 12.0.3923 免费分子模型建模软件；
Moilin 2015 分子构建与观察软件，是Tinker软件的Windows界面程序；
Moilin:分子构建与观察软件；
Mol2Mol 5.6.3 Demo 主要用来进行各种分子文件的转换，支持30种主要分子格式，也可以用来进行3维分子的简单显示；
Mol2Mol:分子文件格式转换软件；
Mole:高性能的大分子三维图形显示计算工具；
MolMol:将pdb等 格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件；
MolPOV 2.1.0 MolPOV是PDB格式至POV格式转化工具；
MolPOV:将PDB文件转化为POV格式文件的软件；
MoluCAD 1.034 Demo 分子建模与显示工具软件演示版；
MoluCAD:全功能的分子建模与显示工具软件；
NOC 3.01 免费的蛋白3维结构构建、显示、分析软件；
OpenAstexViewer 3.0 三维显示Java插件；
OpenMM 6.2.0 分子三维建模程序库；
OpenStructure 1.3.3 开源结构生物学软件；
Ortep-3 for Windows:生成分子的热椭圆形点图；
ORTEP-III 2014.1 用来生成分子的热椭圆形点图；
Oscail 2015 用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包；
Oscail:用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包；
PCMoleeule2 Lite:查看PDB格式文件的免费软件；
PDB Editor 090203 界面友好的PDB文件编辑器；
PDBlib 2.2 显示PDB文件的C++库，可用于编程；
PDViewer: PDB格式文件的查看程序；
PLATON:通用结晶学软件工具；
PovChem 2.1.1 免费软件，将PDB格式分子文件转化为POV格式，再使用POV-Ray v3.1g进行3D加工；
PovChem:将PDB文件转化为POV格式的文件；
POV-Ray 3.7 是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具；
POV-Rayv:生成三维图像工具软件；
Prekin 6.51 将PDB格式文件转换为对应的kinemage格式的专用软件；
Prekin:将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件；
Protein Explorer 2.80 显示蛋白和核酸等大分子三维结构的免费浏览器插件，是RASMOL衍生出的软件，速度快；
ProteinScope LE 1.0.5 免费PDB蛋白三维显示软件，需要系统支持 DirectX 9.0b；
ProteinShader beta 0.9.4 蛋白三维分子显示渲染工具；
PWT(PLATON for Windows Taskbar) 1.17 PLATON是通用结晶学软件工具；
PyRx 0.9.1 三维分子药物辅助设计软件；
QuteMol 0.4.1 开源的三维分子显示软件；
Ramachandran Plot Explorer 1.0 蛋白分子显示软件；
RASMOL 2.7.5.2 观看生物分子3D微观立体结构的软件；
RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构；
RasTop 2.2 为RasMol的图形用户界面软件，免费，简化RASMOL的使用；
RasTop:为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件；
raswin.exe.gz: rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本；
Re_View 1.0 为读取及分析XYZ格式三维分子文件的软件；
ReView:读取及分析XYZ格式三维分子文件；
ScientificGL: C OpenGLAPI三维分子开发工具；
Sojourner:找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件；
StrukEd Demo 化学分子编辑与三维模型生成软件StrukEd Demo；
StrukEd:化学分子编辑与三维模型生成软件；
SweetMollyGrace 1.3 三维分子渲染与动画软件。可读取各种三维格式的文件；
Swiss Pdb Viewer: PDB文件显示与分析软件；
Swiss-PdbViewer 4.1 是一个界面非常友好的同时分析几个蛋白PDB文件；
Tinker 7.0.1 分子设计建模软件，可使用许多常用参数集；
Tinker:与Moilin配套的DOS 下的分子设计建模；
VEGA ZZ 3.0.5.12 支持多种三维格式并可进行显示、计算、分析的免费软件；
Viewer Activex Control:三维分子显示控件；
VisProt3DS 3.03 观察蛋白质和DNA分子PDB结构软件 ；
Visualize:分子建模和研究软件包；
VMD 1.9.2 beta 1 用来显示生物分子的微观立体结构，更棒的功能是可以利用内建的功能，做出动画效果；
VMD:三维分子浏览工具，可以进行动态显示；
Weblab ViewerPro:三维分子浏览工具；
Weblab Viewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子；
WPDB 2.2 美国国家计算机科学与工程学实验室开发的基于Windows的PDB文件查询与处理分析软件；
WPDB: PDB文件检索显示分析软件；
YASARA View 14.12.2 是免费分子显示软；
Zodiac 0.65 用于药物设计的分子三维建模软件包；